Author：
转自 实验万事屋
Release time：
2018
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07
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09
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Hello，大家好，我是贫穷激发创造力的科研鳖，最近做了一批transwell,从预实验到染出还能看的东西着实费了一番心思，但是最后分析数据的时候常用的平台都没有什么好贴。万幸小鳖我斥巨资购买的VPN让我从油管里看到了希望，加上自己的改进，觉得还挺靠谱，分享给亲们~一、首先安装image J + file-openwindows用户直接安，IOS的老铁们先安装个JAVA环境（从JAVA官网就能下来），再安装image J（从官网也能下来）。总的来说还是一劳永逸的，不算很麻烦，我们科研都做了还怕什么麻烦，使用方法不管哪个版本都差不多。打开图片这种老年人操作就不用介绍了吧……不好意思桌面有点乱……二、将图片转换成黑白如图所示，image-type-8-bit三、调整阈值image-adjust-threshold打开调整界面，把原图放在一边，边调节画圈的位置边看着原图，以防用力过猛或隔靴搔痒。上下两个数可以是0/128或28/76什么的，看起来细胞尽量都黑了，背景也比较白就差不多了，不用苛求两个数非得是多少。还要调到B&W，Dark background。都好了之后按apply,就可以关掉阈值界面了~四、分割上一张图所有接触的细胞还都是一片，这么计数肯定会少，所以这一步用watershed把连在一起的细胞分开。process-binary-watershed,细胞被分开了吧五、分析数量analyze-analyze particles打开分析窗口我的重要创新点就是这个调整大小，从0.005开始算起，否则脏的背景也要被计算进去了（0.005也不是绝对的，可以适当调整，根据照片质量不同，我在计数的时候也用过0.008，0.01，0.015不等）。勾选show outlines, display results，选好了之后点OK六、结果展示嗒哒~软件说这一张皂片有...